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11Southern杂交
Southern杂交单元测验
1、单选题：
Southern杂交，预杂交的温度是 。
A: 37℃
B: 55℃
C: 65℃
D: 68℃
答案: 68℃
2、单选题：
本实验中制备探针的方法是 。
A: 随机引物合成法
B: PCR法
C: RT-PCR法
D: 生物素标记法
答案: PCR法
3、多选题：
下列试剂可用于沉淀DNA的有 。
A: 异丙醇
B: 无水乙醇
C: 无水甲醇
D: 70%乙醇
答案: 异丙醇;
无水乙醇
4、多选题：
本实验中提取基因组DNA时，破碎小麦叶片所用的方法 。
A: 冻融法
B: 液氮研磨
C: 加入细胞提取液
D: 超声波法
答案: 液氮研磨 ;
加入细胞提取液
5、判断题：
基因组DNA进行电泳检测，所用琼脂糖凝胶的浓度是0.3%。
A: 正确
B: 错误
答案: 正确
6、判断题：
提取基因组DNA时，应尽量在低温下进行。
A: 正确
B: 错误
答案: 正确
7、判断题：
Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。
A: 正确
B: 错误
答案: 正确
8、判断题：
杂交的目的是封闭膜上所有非特异性吸附位点。
A: 正确
B: 错误
答案: 错误
9、判断题：
洗膜的目的是洗去滤膜上未与DNA杂交的及非特异性杂交的探针。
A: 正确
B: 错误
答案: 正确
10、判断题：
转移膜装置中，放重物的目的是建立液体从皿中经凝胶向膜流动的液流，以洗脱凝胶中变性DNA，并使其聚集在膜上。
A: 正确
B: 错误
答案: 正确
12序列比对与BLAST实验
序列比对与BLAST实验单元测验
1、单选题：
下列关于序列的相似性与同源性概念的说法不正确的是 。
A: 相似性是序列之间相关的一种度量
B: 同源性是指序列所代表的物种具有共同的祖先
C: 序列A与B之间的序列相似性为80%
D: 序列A与B具有80%的同源性
答案: 序列A与B具有80%的同源性
2、单选题：
下列关于序列的两两比对与多序列比对概念的说法不正确的是 。
A: 两两比对指的是两条序列之间的对齐过程
B: 多序列比对指的是三条或三条以上的序列进行对齐的过程
C: 两两比对通常需要以多序列比对为基础进行扩展
D: BLAST输出的结果属于两两比对的形式
答案: 两两比对通常需要以多序列比对为基础进行扩展
3、单选题：
有关BLAST程序的描述不正确的是 。
A: makeblastdb用于准备查询数据库文件
B: BLASTN可用于将一条RNA序列搜索蛋白质数据库
C: BLASTP可用于将一条蛋白质序列搜索蛋白质数据库
D: TBLASTX可用于将一条RNA序列搜索核酸序列数据库
答案: BLASTN可用于将一条RNA序列搜索蛋白质数据库
4、单选题：
BLAST实现过程的说法不正确的是 。
A: 首先要去除低复杂度序列
B: K-mer划分时不需要相互重叠
C: HSP的得分需要根据替换矩阵来完成
D: BLAST的输出结果会标注显著性检验指标
答案: K-mer划分时不需要相互重叠
5、单选题：
下列关于BLAST输出结果的描述不正确的是 。
A: BLAST的输出结果有多种形式，常用的m6和m7格式
B: Bit-score指标可用于不同BLAST结果之间的横向比较
C: E-value值越大，结果越可信
D: Score值越大，结果越可信
答案: E-value值越大，结果越可信
6、单选题：
在查询序列长度，目标数据库大小及计算平台配置相同的情况下，哪个BLAST程序计算速度最慢的 。
A: BLASTN
B: BLASTP
C: BLASTX
D: TBLASTX
答案: TBLASTX
7、多选题：
下列关于BLAST软件说法正确的是 。
A: BLAST是一种局部比对算法
B: BLAST集成了多种不同的比对程序，用于实现不同的搜索目的
C: BLAST过程随着查询序列长度的增加，比对速度会越来越快
D: BLAST常用的目标数据库的类型有核苷酸和蛋白质序列两种
答案: BLAST是一种局部比对算法;
BLAST集成了多种不同的比对程序，用于实现不同的搜索目的;
BLAST常用的目标数据库的类型有核苷酸和蛋白质序列两种
8、多选题：
下列关于序列比对的说法正确的是 。
A: 序列比对的目的就是要寻找序列之间的相似性
B: 序列比对根据比对的策略可分为全局比对和局部比对
C: 序列比对的结果可用于推断序列在结构、功能及进化方面的关系
D: BLAST 工具是一种快速实现序列比对的办法
答案: 序列比对的目的就是要寻找序列之间的相似性;
序列比对根据比对的策略可分为全局比对和局部比对;
序列比对的结果可用于推断序列在结构、功能及进化方面的关系;
BLAST 工具是一种快速实现序列比对的办法
9、多选题：
进行BLAST实验前，需要完成哪些实验准备 。
A: 安装BLAST主程序
B: 准备查询序列
C: 准备目标数据库
D: 安装多序列比对工具
答案: 安装BLAST主程序;
准备查询序列;
准备目标数据库
10、多选题：
下列哪些步骤可以提高BLAST的搜索效率 。
A: 去除查询序列中的低复杂度序列
B: K-mer划分查询序列
C: 显著性指标计算
D: 搜索过程中只考虑高得分片段
答案: 去除查询序列中的低复杂度序列;
K-mer划分查询序列;
搜索过程中只考虑高得分片段
2琼脂糖凝胶电泳和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
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